一、地层介质特性参数的不确定性，地层介质的形成经历了漫长的地质年代，并不断经历自然地质构造运动和人类活动的影响，使地层介质在多数情况下都明显呈现非均质、非线性、各向异性和随机离散等特性。
二、岩土体分类的不确定性,各种岩土体分类法根据工程服务部门都有相应的一套规范或标准，而这些标准规范本身通常是根据大量的经验确定，因而存在一定的不确定性;有时由于不同工程师对标准的理解和处理都不尽相同，因而也可能引起岩土体分类的随机性，进而导致地下建筑结构设计上的不确定。
三、分析模型的不确定性:一般来说，介质所服从的力学性态模型主要是通过室内实验得到其应力，应变关系来确定，如弹性模型、弹塑性模型、粘弹塑性等。尽管这些模型在确定其形式后是固定的，但模型以及模型内的参数在真正反映介质本身的性态及参数方面还存在很大差异，由此引起的不确定即为力学模型的不确定性。
四、载荷与抗力的不确定性:载荷和抗力是影响地下结构分析的主要不确定性因素。结构施工、设计涉及的荷载包括已明确的荷载因素和未明确的其他因素。
五、地下结构施工的不确定因素:影响地下建筑结构施工的不确定性因素很多，诸如在地下开挖和回填的过程中，土层的扰动、支护结构、边界条件和荷载都在不断变化，不确定因素很大。
六、自然条件的不确定性:岩土介质的力学性状与自然条件有着密切关系。当自然条件发生较大的变化时，岩出介质的性状大多会发生很大变化，如果对这种影响估计不足或没有很好的掌握其规律，就会出现意想不到的严重事故，因此自然条件的不确定性对岩土体变破影响采用确定性分析方法是较难以模拟的。